सेन ने जवाहरलाल नेहरू विश्वविद्यालय (जेएनयू) में अर्थशास्त्र पढ़ाया और बाद में अपने चार दशक लंबे करियर में कई महत्वपूर्ण पदों पर रहे।

यूपीए शासन के दौरान 2004 और 2014 के बीच योजना आयोग के सदस्य होने के अलावा, वह 1997 में कृषि मंत्रालय के कृषि लागत और मूल्य आयोग (सीएसीपी) के अध्यक्ष भी थे, जब संयुक्त मोर्चा सरकार सत्ता में थी।

उनके अधीन सीएसीपी को विभिन्न वस्तुओं के लिए न्यूनतम समर्थन मूल्य की सिफारिश करने का कार्य दिया गया था।

1985 में जेएनयू के अर्थशास्त्र अध्ययन केंद्र में शामिल होने से पहले, सेन ने ऑक्सफोर्ड, कैम्ब्रिज, ससेक्स और एसेक्स में अर्थशास्त्र पढ़ाया।